Инновационные проекты требуют учета специфического законодательства: требований к получению статуса резидента технопарков, ОЭЗ или «Сколково», особенностей налогообложения при использовании льготных режимов, правил защиты интеллектуальной собственности и коммерческой тайны, требований валютного законодательства при международном сотрудничестве, специальных лицензионных требований для отдельных видов деятельности, а также правил участия в государственных программах поддержки инноваций. Несоблюдение этих требований может привести к потере льгот и санкциям.